パワプロ2016におけるダイジョーブ博士の時期・条件は、ランダム登場となっています。
従って1回のプレイにおいて、必ずしも登場するという訳ではありません。
但し、ゲーム開始時に消費アイテムの1つである「ダイジョーブのメス」を持ち込む事によって、登場確率を100%とする事も可能になっています。
シリーズを通して存在する強化手術は、パワプロ2016では「とにかく野球が上手くなりたい」という選択肢で選ぶ事が出来ます。
という点ですが、パワプロ2016においても選手育成の成否を大きく左右する劇的なものとなっています。
投手・野手に共通して成功時には体力45、最大体力14、センス20、各経験点48点の全てを得る事が出来ます。
更に投手では球速･スタミナ･コントロール･変化球変化量の増加、野手ではミート･パワー･走力･肩力･守備力･捕球力の増加も全て得る事が可能となっており、一気に選手をパワーアップさせる事が出来ます。
ですが失敗した場合には、前述の成功時の要素が全てマイナスされる事となります。マイナスされる値は成功時のプラスと同等で、更に不眠症といったマイナスの特殊能力まで付与されてしまいます。
パワプロ2016においても、手術というよりはギャンブル性の強いイベントとして扱われている訳です。
公式の確率は明かされていません。「とにかく野球が上手くなりたい」による手術については過去のシリーズの傾向から20～30%程度の成功率とされており、他の選択肢による体力回復等についてはより高い成功率が設定されているものと考えられます。
またゲーム開始時に消費アイテムの1つである「ダイジョーブの成功手形」を持ち込むと、成功確率を100%とする事が可能になっています。
但し持ち込みアイテムは1プレイにつき1つである事から、「ダイジョーブのメス」と併用しての確実な成功を狙える訳ではないので、アイテムが無駄になる可能性がある事を覚悟する必要はあります。